Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema5aQ62217 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema5aQ62217 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema5aQ62217 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema5aQ62217 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema5aQ62217 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema5aQ62217 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema5aQ62217 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema5aQ62217 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema5aQ62217 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema5aQ62217 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema5aQ62217 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema5aQ62217 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema5aQ62217 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema5aQ62217 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema5aQ62217 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema5aQ62217 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema5aQ62217 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema5aQ62217 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema5aQ62217 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema5aQ62217 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema5aQ62217 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema5aQ62217 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema5aQ62217 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema5aQ62217 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema5aQ62217 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 271.7 ms