Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssr4Q62186 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssr4Q62186 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssr4Q62186 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssr4Q62186 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssr4Q62186 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssr4Q62186 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssr4Q62186 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssr4Q62186 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssr4Q62186 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssr4Q62186 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssr4Q62186 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssr4Q62186 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssr4Q62186 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssr4Q62186 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssr4Q62186 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms