Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,39■■□□□ 1,02
Prm3Q62100 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
Prm3Q62100 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC21,39■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC21,38■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21,38■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,37■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC21,36■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,34■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,34■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Prm3Q62100 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1
Prm3Q62100 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1
Prm3Q62100 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1
Prm3Q62100 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,32■■□□□ 1
Prm3Q62100 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,32■■□□□ 1
Prm3Q62100 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC21,32■■□□□ 1
Prm3Q62100 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21,32■■□□□ 1
Prm3Q62100 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21,32■■□□□ 1
Prm3Q62100 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Prm3Q62100 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Prm3Q62100 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Prm3Q62100 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Prm3Q62100 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,3■■□□□ 1
Prm3Q62100 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Prm3Q62100 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Prm3Q62100 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21,3■■□□□ 1
Prm3Q62100 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Prm3Q62100 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Prm3Q62100 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Prm3Q62100 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Prm3Q62100 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,3■■□□□ 1
Prm3Q62100 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Prm3Q62100 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC21,29■■□□□ 1
Prm3Q62100 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Prm3Q62100 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Prm3Q62100 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Prm3Q62100 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Prm3Q62100 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Prm3Q62100 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Prm3Q62100 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Prm3Q62100 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,28■■□□□ 1
Prm3Q62100 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Prm3Q62100 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21,27■■□□□ 1
Prm3Q62100 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC21,27■■□□□ 1
Prm3Q62100 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Prm3Q62100 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21,27■■□□□ 1
Prm3Q62100 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■□□□□ 0,99
Prm3Q62100 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Prm3Q62100 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,26■□□□□ 0,99
Prm3Q62100 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Prm3Q62100 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Prm3Q62100 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC21,26■□□□□ 0,99
Prm3Q62100 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Prm3Q62100 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21,25■□□□□ 0,99
Prm3Q62100 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21,25■□□□□ 0,99
Prm3Q62100 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Prm3Q62100 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC21,25■□□□□ 0,99
Prm3Q62100 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Prm3Q62100 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Prm3Q62100 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Prm3Q62100 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC21,24■□□□□ 0,99
Prm3Q62100 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,24■□□□□ 0,99
Prm3Q62100 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21,24■□□□□ 0,99
Prm3Q62100 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Prm3Q62100 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Prm3Q62100 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Prm3Q62100 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Prm3Q62100 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,23■□□□□ 0,99
Prm3Q62100 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC21,23■□□□□ 0,99
Prm3Q62100 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Prm3Q62100 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Prm3Q62100 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,5 ms