Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Npm1Q61937 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Npm1Q61937 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Npm1Q61937 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Npm1Q61937 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Npm1Q61937 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Npm1Q61937 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Npm1Q61937 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Npm1Q61937 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Npm1Q61937 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Npm1Q61937 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Npm1Q61937 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Npm1Q61937 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Npm1Q61937 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
Npm1Q61937 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
Npm1Q61937 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Npm1Q61937 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Npm1Q61937 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Npm1Q61937 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Npm1Q61937 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Npm1Q61937 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Npm1Q61937 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Npm1Q61937 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Npm1Q61937 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Npm1Q61937 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Npm1Q61937 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Npm1Q61937 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Npm1Q61937 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Npm1Q61937 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Npm1Q61937 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Npm1Q61937 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Npm1Q61937 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Npm1Q61937 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Npm1Q61937 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Npm1Q61937 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Npm1Q61937 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Npm1Q61937 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Npm1Q61937 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Npm1Q61937 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Npm1Q61937 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Npm1Q61937 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Npm1Q61937 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Npm1Q61937 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Npm1Q61937 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Npm1Q61937 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Npm1Q61937 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Npm1Q61937 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Npm1Q61937 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Npm1Q61937 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Npm1Q61937 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Npm1Q61937 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Npm1Q61937 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Npm1Q61937 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Npm1Q61937 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
Npm1Q61937 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Npm1Q61937 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Npm1Q61937 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Npm1Q61937 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Npm1Q61937 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Npm1Q61937 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Npm1Q61937 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Npm1Q61937 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Npm1Q61937 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Npm1Q61937 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Npm1Q61937 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Npm1Q61937 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Npm1Q61937 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Npm1Q61937 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Npm1Q61937 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Npm1Q61937 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Npm1Q61937 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Npm1Q61937 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Npm1Q61937 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Npm1Q61937 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Npm1Q61937 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Npm1Q61937 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Npm1Q61937 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Npm1Q61937 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Npm1Q61937 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Npm1Q61937 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Npm1Q61937 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Npm1Q61937 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Npm1Q61937 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Npm1Q61937 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Npm1Q61937 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Npm1Q61937 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Npm1Q61937 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Npm1Q61937 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Npm1Q61937 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Npm1Q61937 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Npm1Q61937 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Npm1Q61937 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Npm1Q61937 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Npm1Q61937 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Npm1Q61937 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Npm1Q61937 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
Npm1Q61937 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Npm1Q61937 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Npm1Q61937 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Npm1Q61937 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms