Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga7Q61738 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga7Q61738 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga7Q61738 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga7Q61738 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga7Q61738 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga7Q61738 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga7Q61738 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga7Q61738 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga7Q61738 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga7Q61738 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga7Q61738 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga7Q61738 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itga7Q61738 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga7Q61738 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms