Protein–RNA interactions for Protein: Q61490

Alcam, CD166 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlcamQ61490 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AlcamQ61490 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AlcamQ61490 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AlcamQ61490 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AlcamQ61490 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AlcamQ61490 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AlcamQ61490 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AlcamQ61490 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AlcamQ61490 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AlcamQ61490 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AlcamQ61490 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AlcamQ61490 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AlcamQ61490 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AlcamQ61490 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AlcamQ61490 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AlcamQ61490 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AlcamQ61490 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AlcamQ61490 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AlcamQ61490 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AlcamQ61490 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AlcamQ61490 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 345.5 ms