Protein–RNA interactions for Protein: Q61458

Ccnh, Cyclin-H, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnhQ61458 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CcnhQ61458 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CcnhQ61458 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CcnhQ61458 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CcnhQ61458 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CcnhQ61458 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CcnhQ61458 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CcnhQ61458 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CcnhQ61458 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CcnhQ61458 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CcnhQ61458 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcnhQ61458 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcnhQ61458 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcnhQ61458 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcnhQ61458 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CcnhQ61458 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CcnhQ61458 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CcnhQ61458 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CcnhQ61458 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CcnhQ61458 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CcnhQ61458 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CcnhQ61458 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CcnhQ61458 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CcnhQ61458 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CcnhQ61458 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcnhQ61458 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcnhQ61458 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcnhQ61458 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcnhQ61458 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CcnhQ61458 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcnhQ61458 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CcnhQ61458 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CcnhQ61458 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CcnhQ61458 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CcnhQ61458 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CcnhQ61458 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CcnhQ61458 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcnhQ61458 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcnhQ61458 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcnhQ61458 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcnhQ61458 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcnhQ61458 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CcnhQ61458 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CcnhQ61458 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CcnhQ61458 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CcnhQ61458 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CcnhQ61458 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CcnhQ61458 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CcnhQ61458 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CcnhQ61458 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CcnhQ61458 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CcnhQ61458 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CcnhQ61458 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CcnhQ61458 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CcnhQ61458 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms