Protein–RNA interactions for Protein: Q61456

Ccna1, Cyclin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna1Q61456 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccna1Q61456 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccna1Q61456 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccna1Q61456 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccna1Q61456 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccna1Q61456 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccna1Q61456 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccna1Q61456 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccna1Q61456 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccna1Q61456 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccna1Q61456 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccna1Q61456 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccna1Q61456 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccna1Q61456 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccna1Q61456 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccna1Q61456 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccna1Q61456 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccna1Q61456 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccna1Q61456 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccna1Q61456 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccna1Q61456 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccna1Q61456 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccna1Q61456 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccna1Q61456 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccna1Q61456 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccna1Q61456 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccna1Q61456 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccna1Q61456 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccna1Q61456 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccna1Q61456 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccna1Q61456 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccna1Q61456 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccna1Q61456 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccna1Q61456 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccna1Q61456 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccna1Q61456 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccna1Q61456 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccna1Q61456 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccna1Q61456 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccna1Q61456 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccna1Q61456 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccna1Q61456 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccna1Q61456 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccna1Q61456 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccna1Q61456 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccna1Q61456 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccna1Q61456 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccna1Q61456 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccna1Q61456 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccna1Q61456 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccna1Q61456 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccna1Q61456 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccna1Q61456 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccna1Q61456 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccna1Q61456 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccna1Q61456 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccna1Q61456 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccna1Q61456 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccna1Q61456 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccna1Q61456 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccna1Q61456 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccna1Q61456 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccna1Q61456 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccna1Q61456 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccna1Q61456 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccna1Q61456 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccna1Q61456 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccna1Q61456 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccna1Q61456 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccna1Q61456 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccna1Q61456 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccna1Q61456 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccna1Q61456 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccna1Q61456 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms