Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pde3bQ61409 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pde3bQ61409 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pde3bQ61409 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pde3bQ61409 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde3bQ61409 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde3bQ61409 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde3bQ61409 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde3bQ61409 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pde3bQ61409 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pde3bQ61409 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pde3bQ61409 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pde3bQ61409 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde3bQ61409 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde3bQ61409 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pde3bQ61409 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pde3bQ61409 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pde3bQ61409 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pde3bQ61409 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pde3bQ61409 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pde3bQ61409 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pde3bQ61409 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Pde3bQ61409 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pde3bQ61409 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pde3bQ61409 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pde3bQ61409 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pde3bQ61409 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pde3bQ61409 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Pde3bQ61409 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Pde3bQ61409 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pde3bQ61409 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pde3bQ61409 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde3bQ61409 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde3bQ61409 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde3bQ61409 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde3bQ61409 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde3bQ61409 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde3bQ61409 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Pde3bQ61409 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pde3bQ61409 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pde3bQ61409 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pde3bQ61409 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Pde3bQ61409 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pde3bQ61409 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pde3bQ61409 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pde3bQ61409 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pde3bQ61409 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pde3bQ61409 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pde3bQ61409 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pde3bQ61409 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pde3bQ61409 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pde3bQ61409 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pde3bQ61409 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pde3bQ61409 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pde3bQ61409 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pde3bQ61409 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pde3bQ61409 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pde3bQ61409 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pde3bQ61409 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms