Protein–RNA interactions for Protein: Q61221

Hif1a, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif1aQ61221 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hif1aQ61221 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hif1aQ61221 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hif1aQ61221 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms