Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf3Q60980 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klf3Q60980 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms