Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Neurod1Q60867 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Neurod1Q60867 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Neurod1Q60867 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Neurod1Q60867 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Neurod1Q60867 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Neurod1Q60867 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Neurod1Q60867 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Neurod1Q60867 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Neurod1Q60867 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Neurod1Q60867 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Neurod1Q60867 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Neurod1Q60867 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Neurod1Q60867 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Neurod1Q60867 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Neurod1Q60867 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Neurod1Q60867 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Neurod1Q60867 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Neurod1Q60867 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Neurod1Q60867 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Neurod1Q60867 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Neurod1Q60867 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Neurod1Q60867 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Neurod1Q60867 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Neurod1Q60867 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Neurod1Q60867 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Neurod1Q60867 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Neurod1Q60867 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Neurod1Q60867 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Neurod1Q60867 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Neurod1Q60867 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Neurod1Q60867 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Neurod1Q60867 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Neurod1Q60867 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Neurod1Q60867 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Neurod1Q60867 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Neurod1Q60867 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Neurod1Q60867 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Neurod1Q60867 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Neurod1Q60867 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Neurod1Q60867 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Neurod1Q60867 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Neurod1Q60867 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Neurod1Q60867 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Neurod1Q60867 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Neurod1Q60867 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Neurod1Q60867 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Neurod1Q60867 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Neurod1Q60867 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Neurod1Q60867 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Neurod1Q60867 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Neurod1Q60867 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Neurod1Q60867 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Neurod1Q60867 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Neurod1Q60867 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Neurod1Q60867 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Neurod1Q60867 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Neurod1Q60867 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Neurod1Q60867 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Neurod1Q60867 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Neurod1Q60867 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Neurod1Q60867 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Neurod1Q60867 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Neurod1Q60867 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Neurod1Q60867 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Neurod1Q60867 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Neurod1Q60867 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Neurod1Q60867 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Neurod1Q60867 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Neurod1Q60867 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Neurod1Q60867 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Neurod1Q60867 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms