Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mkrn3Q60764 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mkrn3Q60764 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mkrn3Q60764 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Mkrn3Q60764 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mkrn3Q60764 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mkrn3Q60764 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mkrn3Q60764 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mkrn3Q60764 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mkrn3Q60764 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mkrn3Q60764 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mkrn3Q60764 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Mkrn3Q60764 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mkrn3Q60764 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mkrn3Q60764 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mkrn3Q60764 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mkrn3Q60764 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mkrn3Q60764 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mkrn3Q60764 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mkrn3Q60764 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mkrn3Q60764 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mkrn3Q60764 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mkrn3Q60764 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mkrn3Q60764 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mkrn3Q60764 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mkrn3Q60764 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mkrn3Q60764 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mkrn3Q60764 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mkrn3Q60764 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mkrn3Q60764 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mkrn3Q60764 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mkrn3Q60764 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mkrn3Q60764 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mkrn3Q60764 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mkrn3Q60764 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mkrn3Q60764 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mkrn3Q60764 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mkrn3Q60764 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mkrn3Q60764 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms