Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sik1Q60670 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sik1Q60670 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Sik1Q60670 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sik1Q60670 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sik1Q60670 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sik1Q60670 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sik1Q60670 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sik1Q60670 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sik1Q60670 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sik1Q60670 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sik1Q60670 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sik1Q60670 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Sik1Q60670 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sik1Q60670 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sik1Q60670 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sik1Q60670 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sik1Q60670 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sik1Q60670 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sik1Q60670 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sik1Q60670 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sik1Q60670 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sik1Q60670 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sik1Q60670 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sik1Q60670 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sik1Q60670 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sik1Q60670 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sik1Q60670 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sik1Q60670 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sik1Q60670 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sik1Q60670 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sik1Q60670 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sik1Q60670 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sik1Q60670 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sik1Q60670 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sik1Q60670 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sik1Q60670 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sik1Q60670 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sik1Q60670 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sik1Q60670 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sik1Q60670 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sik1Q60670 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sik1Q60670 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sik1Q60670 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sik1Q60670 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Sik1Q60670 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sik1Q60670 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sik1Q60670 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sik1Q60670 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sik1Q60670 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sik1Q60670 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Sik1Q60670 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sik1Q60670 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sik1Q60670 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sik1Q60670 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sik1Q60670 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sik1Q60670 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sik1Q60670 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sik1Q60670 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sik1Q60670 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sik1Q60670 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sik1Q60670 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sik1Q60670 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sik1Q60670 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Sik1Q60670 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sik1Q60670 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Sik1Q60670 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sik1Q60670 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sik1Q60670 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sik1Q60670 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sik1Q60670 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sik1Q60670 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms