Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Satb1Q60611 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Satb1Q60611 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Satb1Q60611 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Satb1Q60611 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Satb1Q60611 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Satb1Q60611 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Satb1Q60611 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Satb1Q60611 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Satb1Q60611 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Satb1Q60611 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Satb1Q60611 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Satb1Q60611 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Satb1Q60611 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Satb1Q60611 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Satb1Q60611 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Satb1Q60611 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms