Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf15Q5UBV8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms