Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc42Q5SV66 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc42Q5SV66 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc42Q5SV66 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc42Q5SV66 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc42Q5SV66 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc42Q5SV66 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc42Q5SV66 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc42Q5SV66 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc42Q5SV66 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc42Q5SV66 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc42Q5SV66 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc42Q5SV66 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc42Q5SV66 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc42Q5SV66 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc42Q5SV66 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc42Q5SV66 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc42Q5SV66 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc42Q5SV66 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc42Q5SV66 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc42Q5SV66 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc42Q5SV66 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc42Q5SV66 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc42Q5SV66 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc42Q5SV66 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc42Q5SV66 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc42Q5SV66 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms