Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Fam71bQ5STT6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam71bQ5STT6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms