Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmprss11eQ5S248 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmprss11eQ5S248 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmprss11eQ5S248 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmprss11eQ5S248 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmprss11eQ5S248 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmprss11eQ5S248 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmprss11eQ5S248 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmprss11eQ5S248 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmprss11eQ5S248 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmprss11eQ5S248 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmprss11eQ5S248 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmprss11eQ5S248 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmprss11eQ5S248 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmprss11eQ5S248 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmprss11eQ5S248 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmprss11eQ5S248 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmprss11eQ5S248 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmprss11eQ5S248 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmprss11eQ5S248 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmprss11eQ5S248 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmprss11eQ5S248 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmprss11eQ5S248 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmprss11eQ5S248 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmprss11eQ5S248 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmprss11eQ5S248 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmprss11eQ5S248 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmprss11eQ5S248 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tmprss11eQ5S248 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmprss11eQ5S248 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tmprss11eQ5S248 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tmprss11eQ5S248 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmprss11eQ5S248 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmprss11eQ5S248 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmprss11eQ5S248 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmprss11eQ5S248 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmprss11eQ5S248 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmprss11eQ5S248 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmprss11eQ5S248 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmprss11eQ5S248 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmprss11eQ5S248 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmprss11eQ5S248 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmprss11eQ5S248 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmprss11eQ5S248 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmprss11eQ5S248 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmprss11eQ5S248 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmprss11eQ5S248 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmprss11eQ5S248 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmprss11eQ5S248 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmprss11eQ5S248 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmprss11eQ5S248 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmprss11eQ5S248 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmprss11eQ5S248 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmprss11eQ5S248 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Tmprss11eQ5S248 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmprss11eQ5S248 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmprss11eQ5S248 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmprss11eQ5S248 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmprss11eQ5S248 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmprss11eQ5S248 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmprss11eQ5S248 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmprss11eQ5S248 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmprss11eQ5S248 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmprss11eQ5S248 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmprss11eQ5S248 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmprss11eQ5S248 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmprss11eQ5S248 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmprss11eQ5S248 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmprss11eQ5S248 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmprss11eQ5S248 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmprss11eQ5S248 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmprss11eQ5S248 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms