Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKV8

Pfpl, Pfpl protein, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfplQ5RKV8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PfplQ5RKV8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PfplQ5RKV8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PfplQ5RKV8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PfplQ5RKV8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PfplQ5RKV8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PfplQ5RKV8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms