Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trav8d-2Q5R1B6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trav8d-2Q5R1B6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trav8d-2Q5R1B6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trav8d-2Q5R1B6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trav8d-2Q5R1B6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trav8d-2Q5R1B6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trav8d-2Q5R1B6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trav8d-2Q5R1B6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trav8d-2Q5R1B6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trav8d-2Q5R1B6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trav8d-2Q5R1B6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trav8d-2Q5R1B6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms