Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CoblQ5NBX1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CoblQ5NBX1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CoblQ5NBX1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CoblQ5NBX1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CoblQ5NBX1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CoblQ5NBX1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CoblQ5NBX1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CoblQ5NBX1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CoblQ5NBX1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CoblQ5NBX1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CoblQ5NBX1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CoblQ5NBX1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CoblQ5NBX1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CoblQ5NBX1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CoblQ5NBX1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CoblQ5NBX1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CoblQ5NBX1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CoblQ5NBX1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CoblQ5NBX1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CoblQ5NBX1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CoblQ5NBX1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CoblQ5NBX1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CoblQ5NBX1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CoblQ5NBX1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CoblQ5NBX1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CoblQ5NBX1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CoblQ5NBX1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CoblQ5NBX1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CoblQ5NBX1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CoblQ5NBX1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CoblQ5NBX1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CoblQ5NBX1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CoblQ5NBX1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CoblQ5NBX1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CoblQ5NBX1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CoblQ5NBX1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CoblQ5NBX1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CoblQ5NBX1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CoblQ5NBX1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CoblQ5NBX1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CoblQ5NBX1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CoblQ5NBX1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CoblQ5NBX1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CoblQ5NBX1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CoblQ5NBX1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CoblQ5NBX1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CoblQ5NBX1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CoblQ5NBX1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CoblQ5NBX1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CoblQ5NBX1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CoblQ5NBX1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CoblQ5NBX1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CoblQ5NBX1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CoblQ5NBX1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CoblQ5NBX1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CoblQ5NBX1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CoblQ5NBX1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CoblQ5NBX1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CoblQ5NBX1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CoblQ5NBX1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CoblQ5NBX1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CoblQ5NBX1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CoblQ5NBX1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CoblQ5NBX1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CoblQ5NBX1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CoblQ5NBX1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CoblQ5NBX1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CoblQ5NBX1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CoblQ5NBX1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CoblQ5NBX1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CoblQ5NBX1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CoblQ5NBX1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CoblQ5NBX1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms