Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SynaQ5G5D5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SynaQ5G5D5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SynaQ5G5D5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SynaQ5G5D5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SynaQ5G5D5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SynaQ5G5D5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynaQ5G5D5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynaQ5G5D5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynaQ5G5D5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynaQ5G5D5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynaQ5G5D5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynaQ5G5D5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SynaQ5G5D5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SynaQ5G5D5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SynaQ5G5D5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynaQ5G5D5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynaQ5G5D5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SynaQ5G5D5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SynaQ5G5D5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SynaQ5G5D5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms