Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Gm3558Q5FWC9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Gm3558Q5FWC9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Gm3558Q5FWC9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Gm3558Q5FWC9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Gm3558Q5FWC9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Gm3558Q5FWC9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Gm3558Q5FWC9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm3558Q5FWC9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3558Q5FWC9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3558Q5FWC9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3558Q5FWC9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3558Q5FWC9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3558Q5FWC9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3558Q5FWC9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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