Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

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Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrc3Q5DU56 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrc3Q5DU56 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
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