Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2f8Q58FA4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2f8Q58FA4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2f8Q58FA4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2f8Q58FA4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2f8Q58FA4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2f8Q58FA4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2f8Q58FA4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2f8Q58FA4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2f8Q58FA4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2f8Q58FA4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2f8Q58FA4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2f8Q58FA4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2f8Q58FA4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2f8Q58FA4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2f8Q58FA4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2f8Q58FA4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2f8Q58FA4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2f8Q58FA4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2f8Q58FA4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2f8Q58FA4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2f8Q58FA4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2f8Q58FA4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2f8Q58FA4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2f8Q58FA4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2f8Q58FA4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
E2f8Q58FA4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2f8Q58FA4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2f8Q58FA4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2f8Q58FA4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2f8Q58FA4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2f8Q58FA4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2f8Q58FA4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2f8Q58FA4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2f8Q58FA4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2f8Q58FA4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2f8Q58FA4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2f8Q58FA4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2f8Q58FA4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2f8Q58FA4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2f8Q58FA4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E2f8Q58FA4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2f8Q58FA4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2f8Q58FA4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
E2f8Q58FA4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2f8Q58FA4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2f8Q58FA4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2f8Q58FA4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2f8Q58FA4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2f8Q58FA4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2f8Q58FA4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2f8Q58FA4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2f8Q58FA4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2f8Q58FA4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2f8Q58FA4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
E2f8Q58FA4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
E2f8Q58FA4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
E2f8Q58FA4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms