Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Tmtc2Q56A06 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmtc2Q56A06 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmtc2Q56A06 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmtc2Q56A06 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmtc2Q56A06 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmtc2Q56A06 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmtc2Q56A06 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmtc2Q56A06 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmtc2Q56A06 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmtc2Q56A06 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmtc2Q56A06 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmtc2Q56A06 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmtc2Q56A06 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmtc2Q56A06 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmtc2Q56A06 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmtc2Q56A06 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmtc2Q56A06 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmtc2Q56A06 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmtc2Q56A06 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmtc2Q56A06 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmtc2Q56A06 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmtc2Q56A06 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmtc2Q56A06 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmtc2Q56A06 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmtc2Q56A06 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms