Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prune2Q52KR3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prune2Q52KR3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prune2Q52KR3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prune2Q52KR3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prune2Q52KR3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prune2Q52KR3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prune2Q52KR3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prune2Q52KR3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prune2Q52KR3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prune2Q52KR3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms