Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Spire1Q52KF3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spire1Q52KF3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Spire1Q52KF3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spire1Q52KF3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spire1Q52KF3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spire1Q52KF3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Spire1Q52KF3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spire1Q52KF3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spire1Q52KF3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spire1Q52KF3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Spire1Q52KF3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms