Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc84Q4VA36 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc84Q4VA36 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc84Q4VA36 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms