Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Khdc1cQ4KL78 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Khdc1cQ4KL78 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms