Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc3lQ4KL14 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc3lQ4KL14 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc3lQ4KL14 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc3lQ4KL14 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc3lQ4KL14 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc3lQ4KL14 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc3lQ4KL14 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc3lQ4KL14 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc3lQ4KL14 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc3lQ4KL14 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc3lQ4KL14 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc3lQ4KL14 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc3lQ4KL14 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc3lQ4KL14 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc3lQ4KL14 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc3lQ4KL14 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc3lQ4KL14 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc3lQ4KL14 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc3lQ4KL14 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc3lQ4KL14 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc3lQ4KL14 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trappc3lQ4KL14 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc3lQ4KL14 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc3lQ4KL14 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc3lQ4KL14 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc3lQ4KL14 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc3lQ4KL14 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc3lQ4KL14 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc3lQ4KL14 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc3lQ4KL14 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc3lQ4KL14 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc3lQ4KL14 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trappc3lQ4KL14 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trappc3lQ4KL14 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trappc3lQ4KL14 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trappc3lQ4KL14 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc3lQ4KL14 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc3lQ4KL14 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc3lQ4KL14 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc3lQ4KL14 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc3lQ4KL14 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc3lQ4KL14 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trappc3lQ4KL14 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trappc3lQ4KL14 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trappc3lQ4KL14 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trappc3lQ4KL14 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trappc3lQ4KL14 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trappc3lQ4KL14 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trappc3lQ4KL14 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms