Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Syne3Q4FZC9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syne3Q4FZC9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms