Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx25Q3ZT31 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snx25Q3ZT31 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx25Q3ZT31 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx25Q3ZT31 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx25Q3ZT31 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx25Q3ZT31 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx25Q3ZT31 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx25Q3ZT31 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx25Q3ZT31 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx25Q3ZT31 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx25Q3ZT31 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx25Q3ZT31 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx25Q3ZT31 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx25Q3ZT31 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx25Q3ZT31 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx25Q3ZT31 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx25Q3ZT31 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx25Q3ZT31 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx25Q3ZT31 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx25Q3ZT31 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx25Q3ZT31 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx25Q3ZT31 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx25Q3ZT31 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms