Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam220aQ3ZN08 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam220aQ3ZN08 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam220aQ3ZN08 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam220aQ3ZN08 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam220aQ3ZN08 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam220aQ3ZN08 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam220aQ3ZN08 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam220aQ3ZN08 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam220aQ3ZN08 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam220aQ3ZN08 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam220aQ3ZN08 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam220aQ3ZN08 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam220aQ3ZN08 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam220aQ3ZN08 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam220aQ3ZN08 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam220aQ3ZN08 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam220aQ3ZN08 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam220aQ3ZN08 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam220aQ3ZN08 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam220aQ3ZN08 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam220aQ3ZN08 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam220aQ3ZN08 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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