Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp4r3cQ3V0Y1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp4r3cQ3V0Y1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp4r3cQ3V0Y1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp4r3cQ3V0Y1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp4r3cQ3V0Y1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp4r3cQ3V0Y1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp4r3cQ3V0Y1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppp4r3cQ3V0Y1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp4r3cQ3V0Y1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms