Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd53Q3V0J4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd53Q3V0J4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd53Q3V0J4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd53Q3V0J4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd53Q3V0J4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd53Q3V0J4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd53Q3V0J4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd53Q3V0J4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd53Q3V0J4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd53Q3V0J4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd53Q3V0J4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd53Q3V0J4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd53Q3V0J4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd53Q3V0J4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd53Q3V0J4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd53Q3V0J4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms