Protein–RNA interactions for Protein: Q3V096

Ankrd42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd42Q3V096 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd42Q3V096 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd42Q3V096 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd42Q3V096 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms