Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY34

Uncharacterized protein C12orf43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UY34 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3UY34 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3UY34 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q3UY34 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3UY34 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3UY34 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3UY34 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3UY34 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3UY34 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3UY34 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3UY34 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3UY34 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3UY34 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3UY34 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3UY34 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3UY34 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3UY34 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3UY34 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3UY34 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3UY34 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3UY34 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3UY34 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3UY34 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3UY34 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3UY34 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3UY34 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3UY34 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UY34 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UY34 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UY34 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UY34 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UY34 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UY34 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UY34 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UY34 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UY34 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UY34 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UY34 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UY34 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UY34 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UY34 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UY34 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q3UY34 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q3UY34 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UY34 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UY34 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UY34 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UY34 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UY34 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UY34 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UY34 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UY34 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UY34 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UY34 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UY34 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UY34 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UY34 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UY34 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UY34 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UY34 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UY34 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UY34 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3UY34 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3UY34 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3UY34 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3UY34 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3UY34 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3UY34 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3UY34 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3UY34 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3UY34 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3UY34 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3UY34 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3UY34 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3UY34 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3UY34 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3UY34 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3UY34 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3UY34 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3UY34 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3UY34 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3UY34 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3UY34 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3UY34 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3UY34 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Q3UY34 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q3UY34 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Q3UY34 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Q3UY34 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Q3UY34 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3UY34 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3UY34 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3UY34 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3UY34 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3UY34 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3UY34 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3UY34 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3UY34 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UY34 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UY34 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms