Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm12888Q3UW77 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm12888Q3UW77 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms