Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnga4Q3UW12 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnga4Q3UW12 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnga4Q3UW12 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnga4Q3UW12 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnga4Q3UW12 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnga4Q3UW12 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnga4Q3UW12 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnga4Q3UW12 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnga4Q3UW12 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnga4Q3UW12 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnga4Q3UW12 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnga4Q3UW12 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnga4Q3UW12 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnga4Q3UW12 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnga4Q3UW12 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnga4Q3UW12 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnga4Q3UW12 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnga4Q3UW12 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnga4Q3UW12 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnga4Q3UW12 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnga4Q3UW12 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnga4Q3UW12 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnga4Q3UW12 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnga4Q3UW12 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cnga4Q3UW12 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms