Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr1d1Q3UV55 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr1d1Q3UV55 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr1d1Q3UV55 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr1d1Q3UV55 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr1d1Q3UV55 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr1d1Q3UV55 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr1d1Q3UV55 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr1d1Q3UV55 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr1d1Q3UV55 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr1d1Q3UV55 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr1d1Q3UV55 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr1d1Q3UV55 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr1d1Q3UV55 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr1d1Q3UV55 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr1d1Q3UV55 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr1d1Q3UV55 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr1d1Q3UV55 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr1d1Q3UV55 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr1d1Q3UV55 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1d1Q3UV55 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1d1Q3UV55 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1d1Q3UV55 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1d1Q3UV55 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr1d1Q3UV55 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr1d1Q3UV55 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr1d1Q3UV55 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.9 ms