Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Prom2Q3UUY6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prom2Q3UUY6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Prom2Q3UUY6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prom2Q3UUY6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prom2Q3UUY6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prom2Q3UUY6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prom2Q3UUY6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prom2Q3UUY6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prom2Q3UUY6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prom2Q3UUY6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prom2Q3UUY6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prom2Q3UUY6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prom2Q3UUY6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prom2Q3UUY6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prom2Q3UUY6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prom2Q3UUY6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prom2Q3UUY6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prom2Q3UUY6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prom2Q3UUY6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prom2Q3UUY6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prom2Q3UUY6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prom2Q3UUY6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prom2Q3UUY6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prom2Q3UUY6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prom2Q3UUY6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prom2Q3UUY6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prom2Q3UUY6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prom2Q3UUY6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Prom2Q3UUY6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Prom2Q3UUY6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prom2Q3UUY6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prom2Q3UUY6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prom2Q3UUY6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prom2Q3UUY6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Prom2Q3UUY6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prom2Q3UUY6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prom2Q3UUY6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prom2Q3UUY6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prom2Q3UUY6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prom2Q3UUY6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prom2Q3UUY6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Prom2Q3UUY6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prom2Q3UUY6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prom2Q3UUY6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prom2Q3UUY6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prom2Q3UUY6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prom2Q3UUY6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prom2Q3UUY6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prom2Q3UUY6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prom2Q3UUY6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prom2Q3UUY6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prom2Q3UUY6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Prom2Q3UUY6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prom2Q3UUY6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prom2Q3UUY6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prom2Q3UUY6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prom2Q3UUY6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prom2Q3UUY6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prom2Q3UUY6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prom2Q3UUY6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prom2Q3UUY6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prom2Q3UUY6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prom2Q3UUY6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prom2Q3UUY6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prom2Q3UUY6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prom2Q3UUY6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prom2Q3UUY6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prom2Q3UUY6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prom2Q3UUY6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prom2Q3UUY6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prom2Q3UUY6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prom2Q3UUY6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prom2Q3UUY6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms