Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trat1Q3UU67 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trat1Q3UU67 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trat1Q3UU67 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trat1Q3UU67 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trat1Q3UU67 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms