Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B230104I21RikQ3USW4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
B230104I21RikQ3USW4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
B230104I21RikQ3USW4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
B230104I21RikQ3USW4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
B230104I21RikQ3USW4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
B230104I21RikQ3USW4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
B230104I21RikQ3USW4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
B230104I21RikQ3USW4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
B230104I21RikQ3USW4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
B230104I21RikQ3USW4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
B230104I21RikQ3USW4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
B230104I21RikQ3USW4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
B230104I21RikQ3USW4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
B230104I21RikQ3USW4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
B230104I21RikQ3USW4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
B230104I21RikQ3USW4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
B230104I21RikQ3USW4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
B230104I21RikQ3USW4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
B230104I21RikQ3USW4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
B230104I21RikQ3USW4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
B230104I21RikQ3USW4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
B230104I21RikQ3USW4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
B230104I21RikQ3USW4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
B230104I21RikQ3USW4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
B230104I21RikQ3USW4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
B230104I21RikQ3USW4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
B230104I21RikQ3USW4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B230104I21RikQ3USW4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
B230104I21RikQ3USW4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
B230104I21RikQ3USW4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
B230104I21RikQ3USW4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
B230104I21RikQ3USW4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B230104I21RikQ3USW4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
B230104I21RikQ3USW4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
B230104I21RikQ3USW4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
B230104I21RikQ3USW4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B230104I21RikQ3USW4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
B230104I21RikQ3USW4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B230104I21RikQ3USW4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
B230104I21RikQ3USW4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
B230104I21RikQ3USW4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B230104I21RikQ3USW4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
B230104I21RikQ3USW4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B230104I21RikQ3USW4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B230104I21RikQ3USW4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B230104I21RikQ3USW4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B230104I21RikQ3USW4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
B230104I21RikQ3USW4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
B230104I21RikQ3USW4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B230104I21RikQ3USW4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
B230104I21RikQ3USW4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms