Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TceancQ3US16 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TceancQ3US16 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TceancQ3US16 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TceancQ3US16 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TceancQ3US16 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TceancQ3US16 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TceancQ3US16 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TceancQ3US16 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TceancQ3US16 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TceancQ3US16 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms