Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc1Q3UPH1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms