Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cracr2aQ3UP38 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cracr2aQ3UP38 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cracr2aQ3UP38 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cracr2aQ3UP38 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cracr2aQ3UP38 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cracr2aQ3UP38 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cracr2aQ3UP38 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cracr2aQ3UP38 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cracr2aQ3UP38 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cracr2aQ3UP38 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cracr2aQ3UP38 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cracr2aQ3UP38 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cracr2aQ3UP38 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cracr2aQ3UP38 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cracr2aQ3UP38 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cracr2aQ3UP38 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cracr2aQ3UP38 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cracr2aQ3UP38 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cracr2aQ3UP38 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cracr2aQ3UP38 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cracr2aQ3UP38 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cracr2aQ3UP38 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cracr2aQ3UP38 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cracr2aQ3UP38 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cracr2aQ3UP38 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cracr2aQ3UP38 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cracr2aQ3UP38 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cracr2aQ3UP38 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cracr2aQ3UP38 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cracr2aQ3UP38 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cracr2aQ3UP38 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cracr2aQ3UP38 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cracr2aQ3UP38 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cracr2aQ3UP38 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cracr2aQ3UP38 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cracr2aQ3UP38 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cracr2aQ3UP38 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cracr2aQ3UP38 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cracr2aQ3UP38 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cracr2aQ3UP38 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cracr2aQ3UP38 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms