Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem253Q3UNB8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem253Q3UNB8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem253Q3UNB8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem253Q3UNB8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem253Q3UNB8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem253Q3UNB8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem253Q3UNB8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem253Q3UNB8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem253Q3UNB8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem253Q3UNB8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem253Q3UNB8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem253Q3UNB8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem253Q3UNB8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem253Q3UNB8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem253Q3UNB8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem253Q3UNB8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem253Q3UNB8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem253Q3UNB8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem253Q3UNB8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem253Q3UNB8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem253Q3UNB8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem253Q3UNB8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmem253Q3UNB8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem253Q3UNB8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem253Q3UNB8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem253Q3UNB8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem253Q3UNB8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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