Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKP4

Ceacam12, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam12Q3UKP4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ceacam12Q3UKP4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ceacam12Q3UKP4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ceacam12Q3UKP4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ceacam12Q3UKP4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ceacam12Q3UKP4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ceacam12Q3UKP4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ceacam12Q3UKP4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ceacam12Q3UKP4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ceacam12Q3UKP4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ceacam12Q3UKP4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ceacam12Q3UKP4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms